本篇故事的主角，17歲的高二女生，無論在課業和體育均表現不佳，都有阿新為她加油打氣，因此對阿新產生了欲言又止的情愫；跟阿新是從小到大一起成長的玩伴，也是高中同班同學，兩人也經常形影不離在一起。
某日小澪發現到同窗好友圓佳也同樣對阿新抱有好感，但同樣心儀阿新的她也不想因此破壞與圓佳的友情；在更進一步跟阿新深交之前，由於一場感情表達上的誤解，與阿新之間的情誼產生了裂痕，感到內疚的小澪希望能跟阿新重修舊好，就不顧危險冒著風雨騎車出去，卻發生了一場讓她命危的車禍。
小澪發生車禍後，夢見自己在跟阿新搭的同一班電車上，她被突然彈到高空後重重摔下來，卻回到了原本的電車但空無一人，電車緩緩駛向了不為人知的「生死邊界」。當她下車後遇見了會說人話的布偶奇萌，並被帶往象徵與人世永別的傳送門，但小澪聽到了穿著和服的少女小菊的警告，並被小菊拉回傳送門之前，回復了將被死亡恐懼侵蝕的靈體。
小澪心急如焚地想要回到現實世界跟阿新賠不是，小菊向她表示她自己的記憶已經發生破碎，必須要獲得車票、重拾記憶才能回到現實世界。在尋求破碎記憶、返回現實世界的漫長路途上，小澪於神社前遇見了從小就有印象的森婆婆，同時也遭到主掌生死邊界的「殯」所阻撓，在面對了自己的恐懼和陰影後，小澪用自己的堅定求生意志和對阿新的心意，逼退了殯的阻撓。
最後小澪順利找回與阿新之間的完整回憶，返回現實世界與阿新重逢，並對阿新以耳語告白，與阿新之間建立了更強烈、更堅定的羈絆。